5 automatisert karyotypingsprogramvare for å kartlegge kromosomene dine

Karyotyping er prosessen med bestilling og sammenkobling av alle kromosomene som finnes i en organisme for å få en helhetlig oversikt over hele kromosomernes kart av en person.

Men la oss først sørge for at vi forstår hvilke kromosomer som er i utgangspunktet. Kromosomer er strukturer som ligner på tråder som er inneholdt i kjernen til hver av kroppens celler.

Hver kromosomstruktur inneholder hele din genetiske informasjonsplan for kroppen din. Dette dikterer hvordan kroppen din er strukturert, reagerer på stimuli, disposisjon til sykdommer, osv. Kvinner har 2 'X' kromosomer, og menn har ett 'X' og ett 'Y'-kromosom. Hver celle i kroppen inneholder 23 par kromosomer, totalt 46 kromosomer.

For at forskere skal kunne forstå kronosekvensene for hver pasient, bruker de karyotypingsprogramvare . Denne typen programvare er utformet for å utføre kromosomanalyse, og den evaluerer strukturen og antallet av en persons kromosomer. Ved å gjøre dette kan forskere og forskere oppdage abnormiteter.

I denne artikkelen vil vi utforske noen flotte programvarealternativer som lar deg utføre karyotypingsanalyse.

Topp 5 automatiserte karyotypingsverktøy som skal brukes i 2019

ArgusSoft

ArgusSoft er et flott programvarealternativ som lar deg automatisk karyotype menneskelige kromosomer ved båndposisjon, og kan også brukes til karyotyping av dyr og plantens kromosomer på nettet.

Nøkkelegenskaper:

G, Q, R-farging
Automatisert karyotyping av menneskelige kromosomer med anerkjennelse av bøyninger
Automatisert karyotyping av svinekromosomer
3 innebygde baser av standard ideogrammer av menneskelige kromosomer med forskjellige clearensnivåer - 400, 550 og 850 nivåer
Kan legge til grunnlag av standardkromosomideogrammer for andre dyre- og plantearter
Prøveforberedelsesmetoder
Inngang av metafaseplatebilder ved hjelp av et kamera og en skanner
Ledsage et bilde med grafikk
Automatisert deling av påført og kontaktende kromosomer
Sammenligning av kromosomer og ideogrammer

Du kan også bruke ArgusSoft til å trene systemet med kromosomeregjenkjenning ved hjelp av forhåndsinnstilte preparater, kan overføre metafaseplatebilder og karyogrammer i innebygd database, kan produsere mønstre av rapporter, korrigere karyogrammer og lagre og skrive ut bilder og analyseresultater.

Du kan få opplæring og støtte for å bruke ArgusSoft fra deres offisielle nettside. Støttesenteret inkluderer trening, vedlikehold og konsulenttjenester.

Prøv ArgusSoft

HiBand av Applied Spectral Imaging

HiBand er en programvare laget av Applied Spectral Imaging, som kan utføre avansert kromosomanalyse ved hjelp av digitale karyotypingsfunksjoner. Denne programvaren

bruker automatiserte skannefunksjoner for en grundig analyse av kromosomstrukturen.

Du kan bruke det brede spekteret av funksjoner som finnes i HiBand for indeksering, telling, lagring og styring av resultatdata. Du kan også bruke denne kraftige programvaren til å skanne kromosomsekvensen automatisk.

Resultatene som ble oppnådd ved bruk av karyotypingsfunksjonene, ble funnet. HiBand kan lagres på et sikkert sted med passordbeskyttede og krypterte lag. Dette gir deg trygghet om å miste viktige sekvenseringsdata, og på grunn av dette forbedrer du også laboratoriens effektivitet.

Sortering gjennom resultatene gjøres på en veldig enkel måte, du trenger bare å søke etter den spesifikke kromosomsekvensen, og alle resultatene vises på en inneholdt skjerm som gir enkel tilgang til å endre, vurdere og legge til merker i alle av filene.

Nøkkelegenskaper:

Brightfield Karyotyping-G-Band og R-Band
Fluorescens Karyotyping-Q-Band, R-Band og FISH
Spektral karyotyping
Automatisk kromosometelling
Kromosom indeksering og klassifisering
Avansert adskillelse av kromosomer og avansert bildeforbedring
Bildegalleri - kan presentere alle tilfeller metafaser og karyotyper på en skjerm
Kan sammenligne kromosomer - se dem ved siden av
Abberant Ideogram - Du kan legge til kromosomer, celler, ideogrammer og merknader i en bildegenerator

HiBand bruker fullt automatiserte arbeidsflyter for økt lab effektivitet, har start-og-gange-skanning funksjoner, finner metafaser, leser strekkoder automatisk, laster opp bilder i sanntid under lysskanning og eksporterer også til lab LIS Central Portal og database.

Prøv HiBand

Ikaros av MetaSystems

Dette karyotypingssystemet har et sterkt intuitivt brukergrensesnitt som tilbyr alle funksjonene på en skjerm. Dette gir enkel og rask tilgang til all informasjonen som er innhentet.

Ikaros kan brukes med Neon, som er en plattform utviklet for å hjelpe med bildedata og saksorganisasjon. Neon samler inn data fra alle bildesjobber, eksterne kilder og lar deg presentere dem på en enkel måte å forstå ved hjelp av et dashboard for saksbehandling.

Dette verktøyet lar deg alltid ha viktig informasjon nær ved hånden og lagres på en sikker måte, men bruker svært sterke dataadministrasjonsalgoritmer, har et godt utvalg av måter å observere data på, og kan gi bestemte søk basert på søkeord og dataegenskaper.

Sjekk ut mer informasjon om Neon og dets funksjoner her .

Ikaros støtter mange forskjellige banding teknikker - Brightfield G-Band og R-Band, Fluorescence Q-Band, R-Band og FISH -, tilbyr et stort antall pre-definerer karyogram former for mennesker, planter og dyr. Du kan enkelt redigere disse skjemaene for å legge til data som kreves for typen forskning du gjør.

Det faktum at du kan sammenligne kromosomer etter klasser eller karyogrammer, gir deg stor nyttig informasjon som gjør at du enkelt kan identifisere forskjeller.

Prøv Ikaros

MetaClass av mikroptisk

MetaClass er en flott karyotyoprogramvare som er designet på en modulær måte. Denne programvaren hjelper deg med å utføre karyotyping og FISH studier av kromosomer.

MetaClass er dannet av følgende moduler:

MetaClass Database

Database som kan installeres med noen av MetaClass-modulene. Lar deg lagre pasientdetaljer og gir deg enkel tilgang til resultatene. Du kan opprette tilpassede rapporter på hvilket som helst språk med denne modulen.

MetaClass Karyotyping

Lar deg studere en karyotype etter at bildene av metafasepreparatfasen er digitalt fanget, og ordne dem i par basert på størrelse, posisjon etc. Denne modulen gir deg ypperlige kvalitetsresultat når det gjelder kromosombånd, og det kan også gi deg profesjonelle rapporter.

Viktige funksjoner inkluderer:

Studien av karyotype analyseres under lysfelt 100X forstørrelse
Kan fange flere metafasebilder
Bildekvaliteten er modifiserbar for skarpere resultater
Automatisk klassifisering av kromosomer
4 skjermvisninger - Metaphase, Karyotype og Unclassified chromosomes vindu
Kan vise kromosom prototyper
Kromosomer som ikke er klassifisert, kan automatisk eller manuelt korrigeres - overposisjoner, separasjoner, kryssinger, rotasjoner, etc.
MTC-øktfiler eller BMP-bilder kan lagres og lastes på nytt når som helst
Kan eksportere individuelle kromosomer til Metaclass Database med mulighet til å legge til kommentarer og notater

Her er et eksempel på en Metaclass karyotyping rapport.

MetaClass FISH

Dette er en analysemodul som lar deg skaffe Fluorescent IN SITU Hybridization (FISH) -bilde. Denne modulen tar bilder ved hjelp av fluorescerende DNA-prober, og lar deg bekrefte genetiske abnormiteter - trisomier, mocrodeleksjoner, kromosomomleggelser, etc.

FISH-bilder analyseres under 100X forstørrelse, og kan for et bredere utvalg av bildeklarhet også ta bilder med forskjellige filtre.

Hvis du er interessert i å finne ut mer informasjon om modulene som presenteres ovenfor, og andre funksjoner, kan du se gjennom MetaClass-katalogen.

Hvis du er en nysgjerrig type og vil se en rapport oppnådd ved å bruke FISH-metoden, kan du

en prøve PDF-fil.

Prøv MetaClass

GenASis Bandview

GenASis Bandview er en annen stor karyotyping programvare som er bygget ut av moduler med forskjellige capabitilites. Du kan bruke denne appen til å utføre karyotypingsdiagnostikk, og oppnå nøyaktige testresultater.

Med denne programvaren kan du fullt ut tilpasse arbeidsflyten og diagnoseprosessen, avhengig av bedriftens behov og målene du prøver å oppnå.

Det brede spekteret av verktøy som tilbys i BandView, er lett tilgjengelig med bare ett klikk på musen, og tilbyr kraftig G / R / C / Q-Band karyotyping-opplevelse. Du kan velge mellom en automatisert eller manuell arbeidsflyt når det gjelder å finne metafaser og ta bilder.

Kromosomavvik, hvis funnet, kan observeres ved tilsetning, sletting eller omplassering av pasientens genetiske materiale. Med BandView kan du bruke bånd av FISH molekylærteknikk.

FISH bruker flourescent probes til å feste til forskjellige deler av kromosomet, slik at programvaren kan oppdage og lokalisere de abnormalittene som finnes i bestemte DNA-sekvenser.

Prøv GenASis Bandview

Konklusjon

I denne artikkelen utforsket vi noen av de beste automatiserte karyotypingsprogramvarene som eksisterer på markedet i slutten av 2018.

Karyotypingsprogramvarealternativene dekket i denne artikkelen, gir deg en rekke funksjoner som vil hjelpe deg med å nå bedriftens mål.

Ved å bruke denne typen programvare, kan du telle tusenvis av kromosomstrukturer raskt, analysere med ulike profesjonelle teknikker, og produsere høyverdige rapporter som gjør det mulig å identifisere eventuelle abnormiteter med letthet.

Vi vil gjerne finne ut hva din mening angår programvaren vi presenterte i denne topp 5-listen. Ta gjerne beskjed ved å bruke kommentarseksjonen nedenfor.

RELATERTE GUIDER DU TRENGER FOR å sjekke ut: